Immunité et Alternative aux Antibiotiques
Thématiques de recherche
L’équipe IALTA concentre ses travaux sur la compréhension approfondie des mécanismes de l’immunité des ruminants face aux infections. Elle développe des approches innovantes visant à renforcer la résilience des ruminants (bovins, ovins et caprins), via le renforcement de leur immunité, dans les contextes où les animaux sont exposés à des agents pathogènes fréquents et responsables de maladies dégradant la santé et la productivité des troupeaux.
Les recherches menées s’appuient sur des stratégies originales de consolidation des barrières physiques avec le milieu intérieur, notamment mammaire et respiratoire, et d’activation de l’immunité innée et acquise. Ces travaux ciblent prioritairement les maladies les plus prépondérantes dans les élevages, qu’elles soient d’étiologie virale ou bactérienne.
L’objectif global de l’équipe est d’améliorer la résilience des troupeaux via la maîtrise des maladies infectieuses, qu’elles soient enzootiques ou émergentes, en approfondissant la compréhension des mécanismes infectieux et des réponses immunitaires associées. Les enjeux auxquels répond IALTA s’inscrivent pleinement dans les défis actuels et futurs des filières : durabilité de l’élevage, adaptation au dérèglement climatique, réduction de l’usage des antibiotiques, et prévention des maladies épizootiques.
Un accent particulier est mis sur l’augmentation de la résistance et de la résilience des animaux face aux infections et aux processus inflammatoires, notamment durant la période péripartum, moment clé de vulnérabilité des femelles laitières.
Les thématiques scientifiques de l’équipe s’organisent autour de trois axes majeurs :
- Etude de la variabilité des réponses immunitaires en lien avec la génétique et l’environnement de vie des ruminants
- Renforcement de l’immunité :
- Vaccinologie appliquée aux maladies émergentes et aux épizooties, pour anticiper et contrer les nouveaux risques sanitaires.
- Entraînement de l’immunité comme alternative à l’antibiothérapie, afin de renforcer les défenses immunitaires et réduire l’incidence des infections enzootiques, comme les mammites.
- Immunolipidomique, visant à caractériser les mécanismes inflammatoires et immunitaires et identifier des biomarqueurs à des fins diagnostiques et de prévention.
Par cette combinaison d’expertises en immunologie, physiopathologie et biologie des systèmes, IALTA contribue au développement de solutions durables pour la santé des ruminants et à l’évolution des pratiques d’élevage vers des modèles plus résiliants et responsables.
Principales expertises
Cytométrie en flux
Le laboratoire est équipé d’un cytomètre MACSQuant10 (Miltenyi) possédant 3 lasers d’excitation (405 nm, 488 nm et 635 nm) et 8 canaux d’émission (V1 450/50, V2 525/50, B1 525/50, B2 585/40, B3 655-730, B4 750LP, R1 655/730, R2 750LP). Il est à la disposition des équipes de l’unité pour leurs analyses.
Contact : Blandine Gaussères blandine.gausseres@envt.fr
Analyse Multiplex des cytokines multi-espèces
Le laboratoire possède un MAGPix qui permet le dosage de divers analytes à l’aide de billes magnétiques. Jusqu’à 50 analytes peuvent être détectés simultanément à partir de 25 µL d’échantillon (sérums, plasmas, surnageant de culture…). Des analyses sont réalisées couramment sur des échantillons des différentes espèces vétérinaires et de laboratoire.
Contact : Blandine Gaussères blandine.gausseres@envt.fr
Lipidomique ciblée
L’étude du rôle des sphingolipides et des oxylipines est innovante dans l’étude de l’inflammation et de la signalisation cellulaire. Leur analyse est rendue possible grâce à une approche ciblée en LC-MS/MS permettant la caractérisation de plusieurs centaines d’analytes.
Contact : Philippe Guerre philippe.guerre@envt.fr et Alix Pierron alix.pierron@envt.fr
Modèles in vitro, ex vivo et in vivo.
L’équipe possède une forte expertise dans l’isolement, la caractérisation, la culture de cellules primaires bovines issues du sang ou de divers tissus tels que la glande mammaire, le poumon ou l’intestin. Afin d’étudier le rôle de l’entrainement ou les réponses immunitaires associées à cet entrainement, des modèles murins d’infection (mammaire, intestinale, pulmonaire, sepsis, …) à Escherichia coli ou Staphylococcus aureus, avec invalidation de certains gènes de l’immunité (CLEC7A, SOCS2) sont développés. De plus, des modèles innovants d’organoïdes bovins de glande mammaire ou d’amygdale sont disponibles dans l’équipe. Des tissus d’animaux invalidés pour des voies spécifiques de l’immunité (intégrines, JAK/STAT, …) sont conservés dans une biobanque en vue du développement futur de lignées cellulaires primaires ou d’organoïdes d’intérêt (intestin, glande mammaire, poumon, peau, vessie, amygdales, …).
Contact : Delphine Payros delphine.payros@inrae.fr et Gilles Foucras gilles.foucras@envt.fr
Membres de l’équipe
Membres permanents
- Gilles FOUCRAS (Professeur, responsable d’équipe, ENVT) ORCID 0000-0002-0363-0337
- Philippe GUERRE (Professeur, ENVT) ORCID 0000-0002-9777-3784
- Delphine PAYROS (CRCN, INRAE) ORCID 0000-0003-4820-7986
- Alix PIERRON (Maître de conférences, ENVT) ORCID 0000-0001-9510-4790
- Didier TARDIEU (Ingénieur de recherche, ENVT)
- Blandine GAUSSERES (Ingénieure d’étude, INRAE) ORCID 0000-0001-7570-4721
- Christian TASCA (Technicien de la recherche, INRAE)
Doctorants, résidents EBVS et personnel technique
- Lucie DUTHEIL, résidente (2022 – 2025), doctorante (2023 – 2026), ORCID 0009-0001-9742-4031
- Elodie LASSALETTE, doctorante (programme CIFRE Olmix, 2024 – 2027), ORCID 0009-0000-2986-5057
- Silvia BELVEDERISI, doctorante (projet européen EUPAW&H CATTLE-AIV, INRAE, 2026 – 2029)
- Justin CARPENTIER, Technicien de laboratoire (projet ANR FlashPox ClearLSD, 2026 – 2027)
5 publications principales
Goetz C, Payros D, Knudsen C, Grundy MM, Lacroix-Lamandé S, Lalmanach AC, Wiedemann A, Piriou-Guzylack L, Archer F, Descamps D, Finot L, Beaumont M. Review: In vitro and ex vivo models advancing the study of host-microbiota interactions across organ systems in farm animals. Animal. 2026 Mar 24:101810. doi: 10.1016/j.animal.2026.101810.
Lassallette E, Baysse AP, Gausseres B, Foucras G, Guerre P. Targeted analysis of sphingolipids and cytokines in plasma of dairy cows after calving reveals distinct impacts of systemic inflammation, ketosis, and mastitis. J Anim Sci Biotechnol. 2026 Jan 12;17(1):6. doi: 10.1186/s40104-025-01325-3.
Dutheil L, Gausseres B,Besnard F, Guzylack-Piriou L, Abou Monsef Y, Gaide N, Arnalot L, Corbiere F, Gaborit M, Launay F, Poujade A, Capitan A, Foucras G. Bovine Lymphocyte Intestinal Retention Defect (BLIRD): a novel recessive immunogenetic disorder in Holstein cattle. Vet Q. 2025;45(1):2566997.
Lesueur J, Walachowski S, Barbey S, Cebron N, Lefebvre R, Launay F, Boichard D, Germon P, Corbiere F and Foucras G. Standardized whole blood assay and bead-based cytokine profiling reveal commonalities and diversity of the response to bacteria and TLR ligands in cattle. Front Immunol 2022;13:871780.
Walachowski S, Breyne K, Secher T, Cougoule C, Guzylack-Piriou L, Meyer E, Foucras G, Tabouret G.Oral supplementation with yeast β-glucans improves the resolution of Escherichia coli-associated inflammatory responses independently of monocyte/macrophage immune training. Front Immunol. 2022 Dec 20;13:1086413. doi:10.3389/fimmu.2022.1086413